答:Go富集我們使用的是Blast2GO R包;KEGG是我們根據(jù)fisher檢驗(yàn)算法自己編寫的程序。
KS<0.05,這個值和p-value的意義相同,是TopGO軟件包中的一個檢驗(yàn)方法。
Q-value<0.01,這個值是對p-value值的一個校正,和FDR概念相似,是fisher檢驗(yàn)中的一個檢驗(yàn)方法。
測序文章一般不用這兩個指標(biāo),涉及到算法的文獻(xiàn)中才有。
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答:Go富集我們使用的是Blast2GO R包;KEGG是我們根據(jù)fisher檢驗(yàn)算法自己編寫的程序。
KS<0.05,這個值和p-value的意義相同,是TopGO軟件包中的一個檢驗(yàn)方法。
Q-value<0.01,這個值是對p-value值的一個校正,和FDR概念相似,是fisher檢驗(yàn)中的一個檢驗(yàn)方法。
測序文章一般不用這兩個指標(biāo),涉及到算法的文獻(xiàn)中才有。