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 分類(lèi): 微生物組測(cè)序

什么是“隨機(jī)森林”算法分析?

隨機(jī)森林算法分析是一種基于決策樹(shù)的高效的機(jī)器學(xué)習(xí)算法,既可以對(duì)微生物樣本進(jìn)行分類(lèi),也可以用于回歸分析,“隨機(jī)森林”算法分析具有極好的準(zhǔn)確率,能夠處理具有高維特征的輸入樣本,能夠評(píng)估各個(gè)特征在分類(lèi)問(wèn)題上的重要性,在微生物研究中作用顯著,“隨機(jī)森林”分析屬于非線(xiàn)性分類(lèi)器,可以挖掘變量之間復(fù)雜的非線(xiàn)性的相互依賴(lài)關(guān)系,通過(guò)“隨機(jī)森林”算法分析,可以找出能夠區(qū)分兩組樣本間差異的關(guān)鍵成分(OTU或物種)

隨機(jī)森林分析圖怎么看

隨機(jī)森林分析圖是物種重要性點(diǎn)圖。橫坐標(biāo)為重要性水平【這里的重要性可以理解為差異顯著性】,圖顯示的是組間/樣品間差異明顯的物種,縱坐標(biāo)為按照重要性排序后的物種名稱(chēng)。反映了分類(lèi)器中對(duì)分類(lèi)效果起主要作用的菌屬,按作用從大到小排列。

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