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發(fā)布于 2022年2月16日

近日，《自然》雜志推出2022值得年度關注的榜單技術，其中空間多組學技術就榜上有名，該技術不僅在2020年被Nature Methods評為年度技術方法，同樣在2021年大量科學先后報道了空間多組學技術在不同領域重大突破和發(fā)現(xiàn)，再次在2022年被評為值得關注的7大年度技術之一。我們不僅感嘆空間轉錄組測序技術的強大，這里就不得不回顧一下在過去的一年中空間轉錄組測序技術的應用和發(fā)展。

2022年值得關注的7大技術榜單

2021年利用空間轉錄組測序技術發(fā)文章呈現(xiàn)井噴式增長，其中已正式發(fā)表文章有40余篇，而空間轉錄組學為特色的預印本bioRxiv搜索“空間轉錄組學（spatial transcriptomics）”一詞，獲得了500余條結果，其中80余條是在2021年提交的，可以說2021年是空間轉錄組測序技術應用好文發(fā)表突飛猛進的一年。

2016年-2021年空間轉錄組文章發(fā)表趨勢和影響因子分布

通過檢索空間轉錄組發(fā)表文章的數(shù)據分析來看，該技術在2021年中得到廣泛應用，并且文章影響因子主要集中在10~20分區(qū)間，其占比高達39%，其次在30分以上占比達到30%，由此可見空間轉錄組測序技術的應用極大提升了文章的質量和檔次。

不僅如此，2021年空間轉錄組測序技術還在物種上有了新的突破，不再局限于人和鼠常見的模式物種，已經開始邁入哺乳動物（豬）、家禽類（雞）、植物類（擬南芥、云杉、楊樹）等新的物種領域，極大拓展其應用范圍。

物種空間轉錄組文獻發(fā)表統(tǒng)計

2021年空間轉錄組在不同組織部位上應用也取得一些新進展：比如骨組織一類就有不少文章發(fā)表，有頭蓋骨[PNAS，IF=11.2]、腰骨骼肌[NatureCommunications，IF=14.9]、肩部肌腱[AnnRheum Dis，IF=19.1 ]；生殖器官有子宮內膜[Nat Genet，IF=27.6]、卵巢[NatureBiotechnology，IF=54.9]；泌尿系統(tǒng)：前列腺[Nature Communications，IF=14.9]、膀胱[NatureCommunications，IF=14.9]；腸道組織：胎兒腸道[Cell，IF=41.6]；脂肪組織：皮下腹部[CellMetabolism，IF=27.3]；腦組織：腦內炎癥[[Ann Rheum Dis，IF=19.1 ]，IF=24.9]、等皮質和海馬[Cell，IF=41.6]、腦神經系統(tǒng)[AnnuRev Neurosci，IF=12.4]、前額葉皮層[Nat Neurosci，IF=24.9]、海馬和前額葉皮質[NatureCommunications，IF=14.9]等都組織區(qū)域都有不錯的研究報道，甚至連取材最困難的皮膚樣本都發(fā)表重要研究成果：皮膚肉芽腫[Nature Immunology ，IF=25.6]，空間轉錄組逐漸在更多的組織類型上得到廣泛的應用，揭示更深層次空間維度生物學表型。

空間轉錄組不同組織應用發(fā)表文獻統(tǒng)計

基于上面數(shù)據我們不難看出來前期研究，腦組織空間基因表達探索最為廣泛，當然還有心臟組織、肝組織前列腺組織；植物主要集中在花序器官的研究，隨著各種組織探索和嘗試，基本上空間轉錄組已經在各種組織中全面開火，不管從技術的前瞻性也好，還是從空間這個維度深度闡釋一些生物學現(xiàn)象，彌補了細胞空間位置信息的趨勢，空間多組學技術毫無疑問成為引領科學研究的風向標。